Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rufy4Q3TYX8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy4Q3TYX8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy4Q3TYX8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms