Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VrtnQ3SYK4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VrtnQ3SYK4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms