Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
V1rd19Q3KNP5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1rd19Q3KNP5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms