Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHI9

Mcm9, DNA helicase MCM9, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm9Q2KHI9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcm9Q2KHI9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mcm9Q2KHI9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mcm9Q2KHI9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms