Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bpifa6Q0VGU8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bpifa6Q0VGU8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms