Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc138Q0VF22 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms