Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zc3h18Q0P678 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zc3h18Q0P678 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3h18Q0P678 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms