Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms