Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sdr16c6Q05A13 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sdr16c6Q05A13 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 285.9 ms