Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1Q04750 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1Q04750 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top1Q04750 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top1Q04750 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1Q04750 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Top1Q04750 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1Q04750 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1Q04750 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top1Q04750 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top1Q04750 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top1Q04750 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1Q04750 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms