Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scg2Q03517 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scg2Q03517 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scg2Q03517 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scg2Q03517 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms