Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Crisp3Q03402 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crisp3Q03402 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms