Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddr1Q03146 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms