Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoa1Q00623 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms