Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bop1P97452 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Bop1P97452 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bop1P97452 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bop1P97452 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms