Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frat1P70339 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frat1P70339 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frat1P70339 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frat1P70339 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frat1P70339 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frat1P70339 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frat1P70339 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frat1P70339 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frat1P70339 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms