Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cux2P70298 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cux2P70298 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cux2P70298 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cux2P70298 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cux2P70298 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cux2P70298 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Cux2P70298 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cux2P70298 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cux2P70298 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Cux2P70298 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cux2P70298 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cux2P70298 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cux2P70298 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cux2P70298 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cux2P70298 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cux2P70298 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cux2P70298 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cux2P70298 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cux2P70298 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cux2P70298 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms