Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd13P70217 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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