Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb4bP68372 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb4bP68372 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb4bP68372 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms