Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smg6P61406 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smg6P61406 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smg6P61406 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smg6P61406 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smg6P61406 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smg6P61406 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smg6P61406 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Smg6P61406 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smg6P61406 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smg6P61406 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smg6P61406 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smg6P61406 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Smg6P61406 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms