Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rims4P60191 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rims4P60191 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rims4P60191 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rims4P60191 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rims4P60191 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rims4P60191 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rims4P60191 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rims4P60191 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms