Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nphp4P59240 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nphp4P59240 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nphp4P59240 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms