Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcif1P59114 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcif1P59114 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcif1P59114 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcif1P59114 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms