Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtnsP57757 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CtnsP57757 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtnsP57757 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtnsP57757 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtnsP57757 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtnsP57757 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CtnsP57757 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CtnsP57757 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtnsP57757 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtnsP57757 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtnsP57757 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtnsP57757 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtnsP57757 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms