Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrlP54846 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrlP54846 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrlP54846 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrlP54846 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrlP54846 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrlP54846 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NrlP54846 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrlP54846 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrlP54846 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrlP54846 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrlP54846 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrlP54846 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrlP54846 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NrlP54846 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NrlP54846 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NrlP54846 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NrlP54846 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NrlP54846 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NrlP54846 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NrlP54846 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NrlP54846 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NrlP54846 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrlP54846 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrlP54846 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrlP54846 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrlP54846 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrlP54846 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrlP54846 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrlP54846 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrlP54846 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrlP54846 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NrlP54846 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NrlP54846 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NrlP54846 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NrlP54846 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NrlP54846 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NrlP54846 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NrlP54846 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NrlP54846 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NrlP54846 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NrlP54846 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NrlP54846 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NrlP54846 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NrlP54846 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NrlP54846 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NrlP54846 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NrlP54846 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NrlP54846 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NrlP54846 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NrlP54846 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NrlP54846 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NrlP54846 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NrlP54846 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NrlP54846 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NrlP54846 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NrlP54846 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NrlP54846 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NrlP54846 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NrlP54846 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NrlP54846 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NrlP54846 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NrlP54846 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NrlP54846 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NrlP54846 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NrlP54846 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NrlP54846 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NrlP54846 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NrlP54846 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NrlP54846 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NrlP54846 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NrlP54846 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NrlP54846 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NrlP54846 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NrlP54846 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NrlP54846 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NrlP54846 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NrlP54846 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NrlP54846 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NrlP54846 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NrlP54846 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NrlP54846 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NrlP54846 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NrlP54846 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NrlP54846 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NrlP54846 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NrlP54846 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NrlP54846 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NrlP54846 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NrlP54846 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NrlP54846 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NrlP54846 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NrlP54846 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NrlP54846 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NrlP54846 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NrlP54846 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NrlP54846 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NrlP54846 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NrlP54846 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NrlP54846 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms