Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upp1P52624 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Upp1P52624 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upp1P52624 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp1P52624 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upp1P52624 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp1P52624 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Upp1P52624 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upp1P52624 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upp1P52624 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upp1P52624 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upp1P52624 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upp1P52624 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms