Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr1P51675 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr1P51675 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr1P51675 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms