Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpc4P51655 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc4P51655 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc4P51655 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms