Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csrp3P50462 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csrp3P50462 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms