Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psen1P49769 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psen1P49769 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psen1P49769 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen1P49769 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen1P49769 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psen1P49769 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psen1P49769 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms