Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk2P38575 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Upk2P38575 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk2P38575 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk2P38575 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk2P38575 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk2P38575 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk2P38575 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk2P38575 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk2P38575 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms