Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab21P35282 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab21P35282 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab21P35282 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab21P35282 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab21P35282 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab21P35282 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab21P35282 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab21P35282 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab21P35282 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab21P35282 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms