Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc10P31257 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc10P31257 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms