Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tacr1P30548 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tacr1P30548 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tacr1P30548 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 328.2 ms