Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept4P28661 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept4P28661 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept4P28661 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept4P28661 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept4P28661 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept4P28661 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept4P28661 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept4P28661 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sept4P28661 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept4P28661 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept4P28661 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept4P28661 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept4P28661 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept4P28661 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept4P28661 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept4P28661 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms