Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afxP27661 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afxP27661 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afxP27661 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afxP27661 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afxP27661 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2afxP27661 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afxP27661 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afxP27661 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2afxP27661 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afxP27661 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afxP27661 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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