Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd8P23463 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd8P23463 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd8P23463 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms