Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prim1P20664 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prim1P20664 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prim1P20664 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prim1P20664 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prim1P20664 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prim1P20664 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prim1P20664 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prim1P20664 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prim1P20664 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prim1P20664 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prim1P20664 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prim1P20664 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Prim1P20664 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms