Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefhP19246 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefhP19246 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefhP19246 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NefhP19246 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NefhP19246 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NefhP19246 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NefhP19246 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefhP19246 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefhP19246 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefhP19246 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefhP19246 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefhP19246 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefhP19246 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefhP19246 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefhP19246 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefhP19246 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NefhP19246 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefhP19246 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefhP19246 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefhP19246 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefhP19246 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefhP19246 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefhP19246 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NefhP19246 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefhP19246 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefhP19246 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefhP19246 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefhP19246 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefhP19246 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefhP19246 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefhP19246 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefhP19246 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefhP19246 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefhP19246 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefhP19246 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefhP19246 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefhP19246 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefhP19246 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NefhP19246 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefhP19246 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefhP19246 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefhP19246 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NefhP19246 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefhP19246 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefhP19246 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefhP19246 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefhP19246 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefhP19246 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NefhP19246 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefhP19246 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefhP19246 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NefhP19246 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NefhP19246 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NefhP19246 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefhP19246 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefhP19246 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefhP19246 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefhP19246 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefhP19246 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NefhP19246 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefhP19246 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefhP19246 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefhP19246 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefhP19246 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefhP19246 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefhP19246 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NefhP19246 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefhP19246 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NefhP19246 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefhP19246 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefhP19246 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefhP19246 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NefhP19246 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefhP19246 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefhP19246 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefhP19246 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefhP19246 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefhP19246 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefhP19246 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefhP19246 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NefhP19246 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefhP19246 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefhP19246 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefhP19246 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefhP19246 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefhP19246 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefhP19246 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefhP19246 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefhP19246 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefhP19246 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefhP19246 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NefhP19246 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefhP19246 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefhP19246 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefhP19246 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefhP19246 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefhP19246 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefhP19246 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefhP19246 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms