Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RargP18911 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RargP18911 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RargP18911 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RargP18911 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RargP18911 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RargP18911 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RargP18911 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RargP18911 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RargP18911 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RargP18911 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RargP18911 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RargP18911 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RargP18911 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RargP18911 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RargP18911 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RargP18911 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RargP18911 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RargP18911 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RargP18911 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RargP18911 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RargP18911 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RargP18911 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RargP18911 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RargP18911 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RargP18911 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RargP18911 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RargP18911 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RargP18911 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RargP18911 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RargP18911 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RargP18911 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RargP18911 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RargP18911 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RargP18911 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RargP18911 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RargP18911 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RargP18911 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RargP18911 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RargP18911 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RargP18911 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RargP18911 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RargP18911 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RargP18911 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RargP18911 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RargP18911 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RargP18911 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RargP18911 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RargP18911 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RargP18911 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RargP18911 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RargP18911 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RargP18911 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RargP18911 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RargP18911 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RargP18911 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RargP18911 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RargP18911 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RargP18911 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RargP18911 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RargP18911 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RargP18911 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RargP18911 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RargP18911 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RargP18911 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RargP18911 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RargP18911 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RargP18911 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RargP18911 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RargP18911 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RargP18911 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RargP18911 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RargP18911 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RargP18911 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RargP18911 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RargP18911 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RargP18911 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RargP18911 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RargP18911 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RargP18911 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RargP18911 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RargP18911 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RargP18911 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RargP18911 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RargP18911 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RargP18911 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RargP18911 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RargP18911 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms