Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P18528 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18528 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18528 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18528 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18528 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18528 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18528 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18528 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18528 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18528 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18528 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18528 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18528 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18528 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18528 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18528 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18528 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18528 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18528 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18528 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18528 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P18528 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18528 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18528 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18528 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18528 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18528 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18528 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18528 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18528 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18528 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18528 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18528 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18528 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18528 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18528 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P18528 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18528 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18528 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18528 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18528 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18528 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18528 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18528 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18528 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18528 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18528 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18528 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18528 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18528 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P18528 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18528 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18528 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18528 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18528 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18528 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18528 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18528 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms