Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou4f1P17208 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f1P17208 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou4f1P17208 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms