Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrm1P12657 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrm1P12657 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms