Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2aP08775 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2aP08775 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2aP08775 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms