Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrygdP04342 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrygdP04342 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrygdP04342 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrygdP04342 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrygdP04342 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrygdP04342 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrygdP04342 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrygdP04342 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrygdP04342 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrygdP04342 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrygdP04342 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrygdP04342 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygdP04342 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrygdP04342 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrygdP04342 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CrygdP04342 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CrygdP04342 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CrygdP04342 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CrygdP04342 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms