Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01797 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01797 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01797 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01797 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01797 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01797 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01797 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01797 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01797 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01797 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01797 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01797 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01797 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01797 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01797 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
P01797 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01797 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01797 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01797 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01797 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01797 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01797 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01797 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01797 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01797 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01797 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01797 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01797 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01797 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01797 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01797 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01797 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01797 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01797 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01797 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01797 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01797 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01797 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01797 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01797 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01797 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01797 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01797 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01797 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01797 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01797 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01797 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01797 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01797 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01797 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01797 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01797 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01797 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01797 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01797 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01797 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01797 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01797 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01797 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01797 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01797 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01797 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01797 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01797 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01797 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01797 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01797 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01797 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01797 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01797 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01797 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01797 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01797 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01797 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01797 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01797 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01797 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01797 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01797 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01797 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01797 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01797 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01797 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01797 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01797 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01797 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms