Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01663 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01663 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01663 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01663 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01663 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01663 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01663 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01663 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01663 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01663 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01663 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01663 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01663 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01663 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01663 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01663 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01663 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01663 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01663 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01663 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01663 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01663 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01663 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01663 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01663 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01663 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01663 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01663 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01663 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01663 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01663 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01663 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01663 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01663 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01663 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01663 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01663 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01663 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01663 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01663 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01663 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01663 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01663 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01663 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01663 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01663 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01663 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01663 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01663 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01663 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01663 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01663 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01663 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01663 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01663 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01663 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01663 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01663 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01663 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01663 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01663 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01663 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01663 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01663 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01663 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01663 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01663 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01663 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01663 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01663 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01663 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01663 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01663 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01663 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01663 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01663 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01663 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01663 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01663 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01663 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01663 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01663 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01663 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms