Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01650 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01650 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01650 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01650 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01650 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01650 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01650 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01650 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01650 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01650 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01650 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01650 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01650 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01650 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01650 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
P01650 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
P01650 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01650 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01650 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01650 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01650 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01650 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01650 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01650 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01650 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01650 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01650 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01650 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01650 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01650 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
P01650 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01650 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01650 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01650 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01650 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
P01650 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01650 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01650 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01650 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01650 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01650 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01650 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01650 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01650 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01650 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01650 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01650 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01650 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01650 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01650 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01650 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01650 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01650 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01650 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01650 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01650 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01650 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01650 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01650 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01650 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01650 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01650 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
P01650 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
P01650 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01650 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01650 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01650 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01650 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01650 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01650 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01650 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01650 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01650 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01650 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01650 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
P01650 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01650 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01650 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01650 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01650 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01650 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01650 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01650 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01650 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01650 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01650 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01650 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms