Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01645 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01645 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01645 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01645 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01645 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01645 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
P01645 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
P01645 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01645 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01645 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01645 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01645 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01645 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01645 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01645 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01645 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01645 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01645 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
P01645 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01645 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01645 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01645 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01645 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01645 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01645 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01645 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01645 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01645 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01645 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01645 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01645 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01645 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01645 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01645 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01645 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01645 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01645 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01645 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01645 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01645 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01645 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01645 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01645 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01645 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01645 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01645 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01645 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01645 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01645 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01645 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01645 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01645 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01645 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01645 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01645 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01645 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01645 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P01645 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01645 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01645 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01645 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01645 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P01645 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01645 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01645 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P01645 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01645 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01645 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01645 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01645 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01645 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01645 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01645 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01645 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01645 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01645 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01645 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01645 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01645 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01645 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
P01645 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01645 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
P01645 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01645 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01645 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01645 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01645 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms