Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sorl1O88307 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sorl1O88307 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms